Pada dasar berdirinya, Madrasah Tsanawiyah Negeri 3 Medan merupakan Madrasah Diniyah Awaliyah yang dikelola oleh Badan Kenaziran Masjid Nurul Iman bersama masyarakat Islam di kawasan Perumnas Helvetia Medan pada Tahun1997. Pihak Badan Kenaziran Masjid Nurul Iman dan masyarakat sekitarnya menyerahkan kepada Kementerian Agama. Oleh karena banyaknya permintaan masyarakat agar Kementerian Agama dapat membangun Madrasah Tsanawiyah Negeri yang sejajar dengan SMP maka pihak Kementerian Agama menegerikan Madrasah Diniyah Awaliyah menjadi Madrasah Tsanawiyah Negeri 3 Medan pada Tahun 1997
Fasilitas yang tersedia di Madrasah Kami antara lain:
Siswa Menghapal Alquran di Pondok Tahfidz
Siswa melaksanakan sholat berjamaah di Masjid
Calon peserta didik baru dapat melihat jadwal tes baca Al-Qur'an pada hari Minggu 19 Mei 2024
Pendaftaran :
02 Mei 2024 - 18 Mei 2024
Verifikasi Berkas :
19 Mei 2024
Pengumuman Lulus Berkas
20 Mei 2024
Tes Akademik :
28 Mei 2024
Tes Baca Alquran :
21 Mei 2024 s/d 25 Mei 2024
Pengumuman Kelulusan :
31 Mei 2024